1、按规定开具
2、合并开具
3、分开开具
4、代垫运费
就像简介里面说的，虽然自己也不是运输企业，但是销售方让自己包含了运费，自己也确实支付了运费，对方也把运费付给了自己。这种情况毫无疑问，按照实际情况，当然是可以开具运费发票的。
但是要开具增值税运输发票，不是随意开的。第一种情况可以合并开具。就是把需要货物的金额，跟运输金额开出在一张发票上面。合并开具的时候，合同上也需要注明，包含了运费。而且分别注明了货物的金额以及运输金额是多少。
如果原先没有协议好承包运费，货物发票已经提前开好了，运输费发票需要单独开，这种情况作为不是运输企业就不能开具。需要分开开具增值税运输费发票，虽然不是运输企业。但是实际业务已经发生，如果一定要开，必须先去税局核定运输费的税种。税局核定之后，才能分开开具相应的运输费发票。
还有一种情况：就是代垫运费的情况，就是出车不是自己公司的车，虽然包了运费，但是也是去外面请的车。这种情况可以以代垫运费的方式，直接让运输方把发票开具给自己的客户就可以了，自己只是中间的一个代办方。
