1、常规放置
木瓜的保存方式是很影响它的味道和口感的，不管是未成熟的还是比较成熟的都要注意。青木瓜富含木瓜蛋白酶等物质，口感和味道还不怎么好，因此未成熟透的青木瓜不适合生食。青木瓜在摘下来后，往往很耐储藏，且有一定的自熟能力，因此有不少人探亲访友时遇不上成熟木瓜，也要摘一些青木瓜回去。如果带回来的木瓜还没有熟透到表皮，也即是表皮还是深绿色，还没有泛黄或是淡橘红色，木瓜按压起来还很硬，则可以常规放置，一边食用一边等木瓜自己成熟到表皮了，再做其他保存处置。注意，木瓜要放置在阴凉干燥处，避免阳光直射，往往能储藏一两个月以上。
2、冰箱冷藏
该方法的话只要家里有冰箱或者有冰柜、冰库都可采取，也是最普遍和最常见的好方法。七八分成熟的木瓜最适合冷藏，不但保存时间长，往往能保存半个月以上，且不影响口感和味道，但建议冷藏保存时间最好控制在10天以内。过熟的木瓜，即使是冷藏，也往往不到一周即发生软烂，且最后口感和味道变得很差。青木瓜不适合冷藏，很多品种的青木瓜在低温下不但不能自然熟，还会导致木瓜变得苦涩难以下咽。
