1、黄连主要含有小檗碱、黄连碱、药根碱、甲基黄连碱、巴马亭等生物碱类以及铝、镁、钾、汞、铅等其他无机元素。药理研究表明，黄连有抗炎、抑制中枢、解热、抗心肌缺血和心律失常、抑制血小板聚集、兴奋呼吸运动、兴奋呼吸运动、兴奋胃肠平滑肌、抗溃疡、利胆、降血糖等作用。
2、黄连一般的用法是2～5克，水煎服，外用及内服适量皆可。黄连的作用比较多，但由于其属大苦大寒的中药，频繁使用或用量较大容易伤害胃气，常说的“苦寒败胃”即是，故对于脾胃虚寒、脾肾虚泻、胃虚呕吐的人不适合使用；中医认为苦燥容易损伤人体的阴津，因此对于阴虚津伤的人也应慎用。
3、黄连作药用时较为讲究，除生用外，还有经酒、姜汁、吴茱萸水等炮制后的黄连用品。酒黄连善于清解头部的火热，用于目赤肿痛、口舌生疮等；姜黄连善清胃热止呕，常用于湿热阻滞的恶心呕吐。
4、黄连解毒汤：黄连、栀子各9克，黄芩、黄柏各6克，水煎服。泻火解毒。治疗大热烦躁，口燥咽干，错语不眠，或热病吐血，衄血，或热甚发斑，或身热下痢，或湿热黄疸，或外科痈疡疔毒，小便黄赤等；急性肠炎、急性黄疸型肝炎、脓毒血症等。
5、黄连胶囊：清热燥湿，泻火解毒，用于湿热蕴毒所致的痢疾、黄疸，症见发热、黄疸、吐泻、纳呆、尿黄如茶、目赤吞酸、牙龈肿痛或大便脓血。
6、黄连姜汁茶：黄连、绿茶、姜汁、红糖各适量。将绿茶、黄连用开水冲泡，5分钟后倒入姜汁、红糖，调匀即可，随意饮服。清热、和胃、止痢，用于痢疾等。
