1、计算日期起始时间不同
2、保修期限不同
3、两者遵循的法律依据不同
计算日期起始时间不同1、保修期的起算日期从业主工程师发给工程竣工证书之日算起；2、缺陷责任期从工程通过竣（交）工验收之日起计算；由于发包人原因导致工程无法按规定期限进行竣（交）工验收的，在承包人提交竣（交）工验收报告90天后，工程自动进入缺陷责任期。
保修期限不同:1、保修国务院的《建筑工程质量管理条例》第四十条规定：“在正常使用条件下，建设工程的最低保修期限为：基础设施工程、房屋建筑的地基基础工程和主体结构工程，为设计文件规定的该工程的合理使用年限;（2）屋面防水工程、有防水要求的卫生间、房间和外墙面的防渗漏，为5年;（3）供热与供冷系统，为2个采暖期、供冷期;（4）电气管线、给排水管道、设备安装和装修工程，为2年。2、缺陷责任期一般有6个月，12个月或者24个月，具体由发承包双方在合同管理中约定。
两者遵循的法律依据不同:1、保修期遵循的是《建筑工程质量管理条例》；2、缺陷责任期遵循的是《建筑工程施工合同示范文本》.
