1、主体资格不同
2、称谓不同
3、意志关系不同
4、财产关系不同
5、财产责任不同
子公司具有独立的主体资格，享有独立的法人地位。而分公司则不具有独立的民事和商事主体资格，仅仅是本公司的分支机构，不具有法人资格。
分公司不具有独立的名称，必须冠以某某分公司以提醒当事人。而子公司有自己独立的名称。
子公司作为独立的法人，在法律上其意志是独立的，母公司对子公司的经营管理活动不能进行直接的命令指挥。而分公司作为本公司的分支机构，其业务的执行、资金的调动完全受制于本公司，与本公司之间是一种管理与被管理的关系。
在财产关系结构上，子公司尽管有母公司的参与，但仍有属于自己的财产。而分公司的财产则全属于本公司，是本公司财产不可分割的组成部分。因此，分公司不存在独立的法律财产，而子公司的财产则具有完全的独立性。
子公司作为独立的法律主体，自主经营、独立核算，其一切后果包括财产责任均完全由自己承受。而分公司作为非独立主体，既没有自己独立的财产，也没有自己独立的意志，因此其经营后果应当归属本公司，由此而产生的财产责任亦由本公司承担。
