毛囊闭锁：本病的主要病因为毛囊闭锁，其发生可能与毛囊结构及功能方而的遗传学异常有关。毛囊皮脂腺导管角化过度，导管口径变小、狭窄、阻塞或闭锁，则影响毛囊壁脱落的上皮细胞和皮脂的正常排出、使得毛囊内容物潴留，招致微生物感染，并引发深部毛囊炎或毛囊周围炎，形成脓肿、窦道及瘢痕。
遗传因索：临床上发现患者往往有家族史。经调查研究表明，本病可能是染色体先行的单基因遗传病，但致病基因的定位尚未明确。
细菌感染：细菌感染是继发性的，虽然在患者皮损中可培养到金黄色葡萄球菌、白色葡萄球菌、链球菌或双球菌、大肠埃希菌及铜绿假单胞菌等，但检出的细菌株复杂不稳定，常岁发病部位的不同而有所变化，且细菌培养阴性者不在少数。
免疫因素：本病可与坏疽性脓皮病、Crohn病等免疫性疾病并发。病情活动时让往往有血沉加快、外周血白细胞总数及功能改变、蛋白电泳图谱改变等。组织病理有肉芽肿样反应，抗生素治疗效果欠佳，而糖皮质激素及环孢素等免疫抑制剂治疗有效，提示免疫因素在本病发病中起重要作用。
其他因素：反常性痤疮多于青春期前后初发，患者大多为油性皮肤。男性患者绝经后病情明显减轻，甚至完全消退，提示性激素水平与发病有关。
